南京农业大学生物信息中心是校级生物信息共享技术平台和交叉科学研究机构，主要从事生物信息学、计算生物学、人工智能及大数据的理论、方法的研究，构建生物信息学高性能计算平台，承担学校相关领域的教学和培训任务。中心核心任务为，依托校前沿交叉研究院，在校内外及国际农业生命科学相关领域开展紧密合作，依托学校现有极为丰富的各类种质资源和生物数据，建立开放共享的公益性数据库资源和服务平台，通过计算方法支持和解决重要的农业生物学问题。
中心配备有高性能计算平台，坚持以开发新统计模型及算法为基础，理论研究及实际应用并重的策略。通过新模型、新算法的开发，为生物学家提供更精确的分析工具，发现并快速解决生物信息学最前沿的问题。在基于高通量测序数据数据分析的基因组学、基因突变及关联分析、表观基因组学等领域有丰富的经验。